(1)检查病人后，应立即进行床侧清洗，洗涤间清洗按漏水测试、手工清洗、消毒液侵洗、无菌水洗净、妥善保管的程序进行。
(2)内镜本身不能进行高温高压灭菌(通常能高温高压灭菌会在外观上标有“AUTOCLAVE”或“AUTOCLAVABLE”或涂有绿色标识)。
(3)确认清洗工具没有脏污，防水盖内侧没有水滴，确认清洗工具没有磨损划痕、裂缝、扭曲、金属与刷毛脱落等，劣质清洗工具不但不能有效清洗内镜，反而能造成内镜破损。
(4)在保存内镜之前，请确认内镜表面和所有管道完全干燥，残留水汽有助于空气中的细菌在内镜内外繁殖增生，造成污染。
(5)干净的内镜应该垂直挂放在干燥、温度适中的地方，手提箱不宜用作保存清洗和消毒后的内镜，只可用作运输往来工具。
